肛周脓肿发生后应认真对待，发生在肛门两侧的坐骨直肠窝和骨盆直肠窝及男性前侧的会阴筋膜下的脓肿最为凶险，如果不及时处理，可能会导致感染性休克，甚至危及生命。
治疗方法：
1.药物治疗：
使用广谱抗生素，替硝唑、罗红霉素分散片。
2.手术治疗
（1）切开排脓在局部麻醉下，从脓腔中间部位，切开小口排脓，术后用甲硝唑冲洗脓腔，并放置油纱条引流。
属于暂时性的应急处理，或是二次手术疗法的第一次手术。可以排出脓液，迅速减轻症状，但不能代替根治术，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行根治术。
（2）根治术①低位脓肿－直接切开。②马蹄脓肿－切开加旷置。③高位脓肿－挂线术。④高位脓肿-等压引流术。由于切割挂线依然切断了肛直环，痛苦大，创口深。为了进一步降低手术创伤，可以采取双向等压引流手术治疗，术中采取半切割挂线，并放置引流管，就可以不切断肛直环而使脓腔愈合。
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肛周脓肿，又称肛管直肠周围脓肿，中医称为肛痈。肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性疾病，属于细菌感染，是肛瘘的前身。本病与肛瘘是肛肠三大疾病之一，发病率约为2%，占肛肠疾病的8%～25%。多见于20～40岁的男性，男性发病率是女性的3～4倍，小儿发病率也相对较高。
治疗方法：
肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术有两种方式。
1.单纯性脓肿的治疗
可在截石位或侧卧下，用局麻或腰麻，在脓肿部位做放射状切口，放出脓液后，伸入食指探查脓腔大小，分开其间隔。必要时将切口边缘皮肤切开少许，以利引流，最后用凡士林纱条放入脓腔做引流。
2.脓腔与肛瘘相通的脓肿
可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。
如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治愈，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治愈率高。
本病的治疗没有太多选择，治愈的方法只有手术，且越早越好。在无条件或身体条件不允许手术的肛周脓肿的治疗方法：
1.药物治疗
（1）抗炎表浅的脓肿可以选择口服抗生素，一般用广谱抗生素。对范围相对大的脓肿需要联合用药，甲硝唑、硫酸依替米星、卡那霉素、链霉素等。
（2）外用药涂金黄膏、活血止痛散、四黄膏、玉露膏等。
（3）中药内服明·薛已校注的《外科精要》中提出初起予以消散，成脓期予以托毒的治疗理念。可以用仙方活命饮、黄连解毒汤加减。
2.手术治疗
（1）抽脓减压局部消毒，用20ml注射器从脓肿最薄弱处刺入脓腔，抽取脓液，边抽边上下移动针头，直至无脓可抽。
本方法可以暂时减轻脓腔张力，缓解疼痛，适用于临时的应急处理，但不能代替手术。如果病情发展快，如坏死性筋膜炎等，就不能用，以免耽误病情。